La interfaz de usuario de Pikopixel es minimalista y avanzada. Hay una serie de configuraciones para elegir y una galería privada para mostrar sus creaciones. El programa también ofrece varias herramientas para pintores profesionales. La aplicación es fácil de usar y ofrece muchas herramientas para crear su arte de píxeles. Sin embargo, algunos usuarios no están entusiasmados por la interfaz de usuario. Esto es comprensible ya que esta aplicación está dirigida al aficionado, así como al profesional.
La herramienta de dibujo básica de Pikopixel le permite dibujar formas e imágenes. Otras herramientas útiles incluyen una varita mágica, herramientas de dibujo de forma y un compositor de sintonía. El software le permite trabajar con capas y funciona en una moda multicapa. También hay paneles activados por llaveros y múltiples unds que le permiten trabajar en múltiples dibujos simultáneamente. Al igual que con cualquier programa gratuito, Pikopixel no requiere mucho espacio en el disco y se puede instalar sin mucho la molestia.
Pikopixel es un editor de imágenes de raster gratuito para MacOS, Linux y BSD. La aplicación le permite crear iconos en el estilo de Pixel Art, con funciones ilimitadas de deshacer y rehacer. A diferencia de otras aplicaciones, no requiere conocimiento previo de Pixel Art. Más bien, se organiza en módulos independientes separados, cada uno con su propio conjunto único de características. Los que trabajan en el escritorio de softwares pueden personalizarlo utilizando el pequeño visor. Hay una serie de otras características disponibles, incluidas las capas y la mezcla de color lineal.